اهداف کلی معاونت بهداشتی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی کاشان:
1- تامین، حفظ و ارتقاء سلامت جسمی، روحی ، روانی ، اجتماعی و معنوی جمعیت تحت پوشش دانشگاه
2- تامین عدالت در ارائه و توزیع خدمات آموزشی، پژوهشی، بهداشتی،درمانی
3- دستیابی به بالاترین رضایتمندی مردم
4- بستر سازی تلفیق آموزه های دینی در آموزش و پژوهش و ارائه خدمات سلامت
5- دستیابی به یکی از قطب های علمی حوزه سلامت
6- افزایش سهم دانشگاه در تولید عالم و محقق در حوزه علوم پزشکی
7- حضور در عرصه بین المللی ارائه خدمات آموزشی، پژوهشی، بهداشتی،درمانی
8- تاثیر گذاری بر مدیریت و سیاست گذاری های کلان نظلم سلامت کشور
9- تامین و توسعه منابع جهت به کار گیری موثر در نظام سلامت
